【eBay輸出】税務調査の当日に見られること｜立ち会った税理士が指摘事項を解説

「税務署から調査の連絡が来たけれど、当日は何を聞かれて、何を見られるのか」。

eBay輸出の税務調査は、事業の中身の聞き取りから始まり、売上・経費・消費税還付の順に、帳簿とeBayのレポート・通帳・カード明細・請求書・輸出の書類を突き合わせて確認されます。当事務所が立ち会った調査では1日では終わらず、書類を預けて後日に続きました。

この記事では、当事務所が実際に立ち会ったeBay輸出の税務調査をもとに、当日の流れと帳簿の指摘事項を、eBay輸出セラーの記帳と消費税還付の申告を担当している税理士・公認会計士が解説します。この調査は、税務署から連絡を受けた後にご依頼いただいたもので、調査の対象となった年分の記帳と申告は当事務所が担当したものではありません。

読み終えるころには、調査の日までにご自身の帳簿のどこを確かめ、どの資料を出せるようにしておけばよいかを判断できます。

当事務所が立ち会ったeBay輸出の税務調査は、午前の聞き取りと午後の資料の確認で1日がかりになり、その日では終わりませんでした。

自宅や事務所に調査官が来る実地の調査では、原則として事前通知があります。日時・場所・対象の税目と期間・目的などが電話等で伝えられますが、事前通知のない調査もあります。

日時は都合を伝えて調整できます。一方、調査に何日かかるかは事前には知らされません（国税庁「税務調査手続に関するFAQ」問16・19・20）。

当日は、次の順で進みました。

• 午前は、事業の中身の聞き取り
• 昼の休憩を挟み、午後は帳簿と資料の確認
• 最後に、書類の預け入れ（預り証の受け取り）と次回の日程の決定

帳簿や書類の預かりは本人の承諾のうえで行われ、必要がなくなれば返されます（同問10・11）。預けるときは、何を預けたかが書かれた預り証を受け取ります。

調査には税理士が立ち会い、本人に代わって説明することができます（同問33）。当事務所で申告していない方の調査でも、連絡を受けた後からお引き受けしております。連絡が来たときの対応や書類の準備は、次の記事で解説しております。

【eBay輸出】税務調査の連絡が来たら｜消費税還付で見られる書類と対応を税理士が解説

最初の聞き取りでは、仕入から入金までのお金と物の流れを、ご自身の言葉で説明できるかを見られます。

実際の調査では、最初に次の内容を聞かれました。

• 開業の時期ときっかけ
• 仕入先（国内か海外か）
• 販売先の国
• 配送の方法（自分で行うか代行業者を使うか）と配送会社
• eBayからPayoneerを経て国内の銀行に入るまでの資金の流れ
• 売上レポートの出し方
• 商品の価格帯
• 出品や配送に使うツール

調査官は、事前に決算書・申告書を見てきています。実際の調査では「この数字で事業が続けられるのか」という疑問から質問が始まりました。申告の数字と事業の実態が合っているかを確かめるためです。

答えた内容は、午後の確認で裏付けとなる資料を求められます。分からないことは推測で答えず、資料を確認してから答えるほうが、後で説明が食い違いません。

当事務所が立ち会った調査では、Payoneerから銀行に移した金額を売上としていた点を指摘されました。手数料が差し引かれた後の入金額で記帳していたため、次のずれがありました。

• 12月の売上のうち、翌年1月に入金された分の計上漏れ
• 年末にPayoneerに残っていた残高に対応する売上の計上漏れ
• eBayの手数料の計上漏れ（売上も同じ金額だけ少なく計上）

入金額で売上を立てていると、12月の売上と年末のPayoneer残高が漏れていないかを確認されます。

調査官からは、Seller Hub → Payments → Reportsで取得する売上レポートを使い、年間の売上総額を出し直すよう求められました。本来は、売上として計上する取引の総額を確認し、手数料や返金を分けて記帳します。

返金（refund）、購入者保証の請求（claims）、その他の手数料など、eBayで差し引かれる項目の中身も一つずつ確認されました。入金額と合うかだけでなく、なぜ差し引かれたのかを説明できる資料が求められます。

売上の計上日と為替換算は、次の記事で解説しております。

【eBay輸出】確定申告ガイド｜売上税・為替・消費税還付と税理士費用

年末のPayoneer残高の扱いはこちらです。

【eBay輸出】為替差損益と円換算｜ドル払い・年末の売掛金・個人と法人の違い

カード明細だけの記帳

カードの利用明細だけでは、基本的に「いつ、どの店に、いくら払ったか」までしか分かりません。実際の調査では、ネット購入分について、何を買ったかが分かる購入履歴や請求書を求められました。

カードの明細だけでは何を買ったかが分からないため、購入履歴や請求書で中身を示すよう求められます。

本会員カードと家族カードの明細から、同じ支払いを二重に入力していないかも確認されました。カード払いの明細と現金払いとして入力した領収書が、同じ支払いではないかという確認もありました。

在庫のつながり

前の年の12月末の在庫である期末在庫が、次の年の初めの期首在庫にそのまま引き継がれているかも見られました。ここがつながっていないと、その差額だけ利益がずれます。

前年の決算書と当年の帳簿を並べ、在庫の金額が一致しているか確認することをおすすめします。

【物販・せどりの棚卸】年末在庫の数え方と売れ残りの処理を税理士が解説

車と過去の年の書類

車のローン返済額を、そのまま車両費にしていた点も確認されました。車の取得費用は、返済額ではなく、取得金額をもとに計算する減価償却費（取得費用を使用期間に配分した経費）で計上します。

計算を確かめるため、調査対象の年より前に取得した車の売買契約書なども求められました。対象年の確認に必要なら、それ以前の書類を確認することもあります（同問9）。車を売ったときに取得時の書類を処分していると、説明が難しくなります。

当事務所では、eBay輸出の税務調査の立会いから、eBayのレポートをもとにした売上の出し直し、修正申告まで、有資格者が直接担当しております。全国どこからでもオンラインでご相談いただけます。

eBay輸出の消費税還付では、仕入の適格請求書と、国際送料を差し引いていないかを確認されます。

仕入の消費税を差し引く仕入税額控除には、原則として帳簿と適格請求書（登録番号など所定の事項が記載された請求書や納品書）の保存が必要です（国税庁タックスアンサーNo.6625）。

実際の調査では、商品と一緒に届いた納品書に登録番号がなく、要件を満たしていない可能性を指摘されました。ネットで仕入れた分は、購入画面から要件を満たす請求書・領収書を出して保存しておくことをおすすめします。

個人から古物を仕入れる場合には、古物商の許可を受け、所定の要件を満たせば、帳簿の記載だけで仕入税額控除を受けられる特例があります。

【メルカリの消費税】仕入はインボイスなしで100％控除｜古物商特例を税理士が解説

実際の調査では、国際送料を課税仕入（仕入税額控除の対象となる仕入や経費）に含めていた点も指摘されました。国外への貨物輸送は輸出免税（輸出に関する取引の消費税が免除される扱い）のため、その国際送料から仕入の消費税は差し引けません。差し引くと、その分だけ還付額が多くなります。

【eBay輸出】経費にできるもの一覧｜手数料・送料の消費税還付の扱いまで税理士が解説

輸出免税の証明書類も確認されます。輸出許可書や、20万円以下の郵便物についての引受けの書類・発送伝票の控えは、7年間の保存が必要です（国税庁タックスアンサーNo.6551）。

当事務所が立ち会った調査では、件数が多いためデータで渡しました。配送会社から取り寄せていない分もあり、調査の後に取り寄せることになりました。発送の記録と保存済みの書類を突き合わせ、不足分を把握しておくことをおすすめします。

赤字の申告が続くと、「その赤字でどうやって生活しているのか」を聞かれます。実際の調査でも、生活費の出どころを確認されました。

赤字の申告が続いていると、生活費をどうまかなっているかと、家族の口座のお金の流れを聞かれます。

家族名義の口座の入出金も確認されました。事業のお金が家族の口座を通っていないか、家族の口座から事業用の口座へ移したお金がどこから来たのかを、説明できるようにしておくことをおすすめします。

国税庁FAQ問7でも、法人の例として、事業との関係が疑われる個人名義の預金の提示を求めることは調査の範囲内とされています。

赤字に仕入の先行や値下げ販売などの理由がある場合は、その理由を帳簿と資料の数字で説明できるように準備しておくことをおすすめします。

申告を税理士に任せていても、申告書の数字の中身を説明するのは事業主ご本人です。調査の日までに、決算書の売上・仕入・在庫・経費の金額がどの資料から来ているかを確かめておくと、当日の説明が食い違いません。

調査で誤りがあれば説明を受け、原則として修正申告（申告した税額の不足などを訂正する申告）を勧められます。応じるかは任意で、応じなければ税務署が更正（申告内容を訂正する処分）を行います。修正申告をした後は不服申立てができないため、説明を受けた内容を確かめてから判断します（同問24・25）。同じ誤りが前の年にも疑われれば、調べる年が広がることもあります（同問32）。

• 当事務所が立ち会った調査は、午前の聞き取りと午後の資料の確認で1日がかりになり、後日に続きました。
• 入金額で売上を立てていると、12月の売上と年末のPayoneer残高の漏れを確認されます。
• カードの明細だけでは足りず、購入履歴や請求書で何を買ったかを示すよう求められます。
• 消費税還付では、仕入の適格請求書と、国際送料を差し引いていないかを確認されます。
• 赤字の申告が続いていると、生活費の出どころと家族の口座のお金の流れを聞かれます。

実際の調査での指摘事項は、ほとんどが毎月の記帳の段階で防げるものです。eBayのレポートからの売上の記帳、カード明細と購入履歴の突き合わせ、年末のPayoneer残高と在庫の確認、輸出の書類の取り寄せと保存は、毎月・毎年続ける作業になります。

当事務所では、eBay輸出の毎月の記帳から、消費税還付の申告、税務調査の立会いまでお手伝いしております。